衡水市冀州区人民检察院始建于1951年5月，原冀县人民检察署改为冀县人民检察院。1958年9月冀县、枣强、武邑、衡水四县合并为衡水县，冀县人民检察院被撤销。1961年5月衡水大县分为小县，冀县、枣强县和为冀县，冀县人民检察院恢复。1966年成立“冀县无产阶级专政委员会”。1967年3月，冀县人民检察院被撤销。1978年8月，根据中央21号文件《关于建立人民检察院的指示》，同年12月冀县人民检察院恢复重建，正式挂牌办公。1993年，冀县撤县设市，原冀县人民检察院更名为冀州市人民检察院。2016年，冀州市撤市设区，原冀州市人民检察院更名为衡水市冀州区人民检察院。2017年12月，因体制改革，12名干警转隶至冀州区监察委，现有编制45人，下设五个职能机构。

近年来，冀州区检察院坚持以习近平总书记系列重要讲话精神为指导，立足检察职能，抓班子带队伍，强化法律监督，维护公平正义，服务地方经济发展大局，不断开创检察工作新局面。被授予“全国先进基层检察院”称号，两次被最高人民检察院荣记“集体一等功”、被评为“全国检察机关文明接待室”单位、“全国青少年维权岗”单位、河北省“文明单位”等，全省第一家档案目标管理6A县级单位，衡水市第一家6A级单位。